



信息概要
16S rDNA测序V3-V4区扩增子分析是一种基于高通量测序技术的微生物群落研究方法,通过扩增细菌和古菌16S rRNA基因的V3-V4可变区,实现对样本中微生物组成和多样性的精准解析。该技术广泛应用于环境微生物、肠道菌群、工业微生物等领域,为微生物生态研究、疾病诊断、生物工程等提供重要数据支持。检测的重要性在于能够揭示微生物群落的物种分布、丰度差异以及功能潜力,为科研和产业应用提供关键依据。
检测项目
α多样性分析,β多样性分析,物种组成分析,群落结构分析,差异物种分析,功能预测分析,样本间比较分析,核心微生物分析,稀有物种分析,优势菌群分析,系统发育分析,环境因子关联分析,聚类分析,PCoA分析,NMDS分析,LEfSe分析,ANOSIM分析,Tax4Fun预测,PICRUSt预测,KEGG通路预测
检测范围
土壤微生物,水体微生物,肠道微生物,口腔微生物,皮肤微生物,发酵食品微生物,工业废水微生物,空气微生物,极端环境微生物,植物根际微生物,海洋沉积物微生物,药用微生物,病原微生物,共生微生物,环境污染物降解微生物,农业微生物,畜牧微生物,食品添加剂微生物,化妆品微生物,生物膜微生物
检测方法
PCR扩增:使用特异性引物对V3-V4区进行扩增。
凝胶电泳:验证PCR产物大小和纯度。
文库构建:对扩增产物进行片段筛选和接头连接。
定量检测:通过Qubit或qPCR对文库进行定量。
高通量测序:采用Illumina平台进行双端测序。
数据质控:过滤低质量序列和嵌合体。
序列拼接:将双端测序数据合并为完整序列。
OTU聚类:按相似度阈值进行序列聚类。
物种注释:比对数据库进行物种分类。
多样性计算:计算Alpha和Beta多样性指数。
统计分析:使用R语言进行差异显著性检验。
可视化分析:生成热图、柱状图等结果图表。
功能预测:基于物种组成预测群落功能。
环境因子关联:分析微生物与环境变量的相关性。
机器学习分析:利用随机森林等算法挖掘特征物种。
检测仪器
PCR仪,电泳仪,Qubit荧光定量仪,Agilent 2100生物分析仪,Illumina MiSeq测序仪,Illumina NovaSeq测序仪,Nanodrop分光光度计,离心机,超纯水系统,生物安全柜,恒温混匀仪,微量移液器,凝胶成像系统,qPCR仪,冷冻离心机
我们的实力
部分实验仪器




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